Das liegt an deiner komischen Konstruktion. while($a == $id) ist der Fehler, das tritt nur genau einmal ein. Nämlich beim ersten Durchlauf (beide 0) danach nicht mehr und die Schleife ist zuende. Wieso machst du das denn überhaupt so?

Ich frage mich was du überhaupt machen willst. Es sieht so aus als würdest du die ID vom dem Datensatz auslesen, bei dem die ID = $id ist. Das macht einfach keinen Sinn. Beispiel $id = 0: Deine Anfrage an die DB: Gib mir die ID vom Datensatz wo die ID gleich 0 ist. Antwort der Datenbank: 0. Wozu das ganze?

Also ist das Ergebnis der Abfrage immer gleich $id. Im ersten Schleifendurchlauf ist $id = 0, $a auch. Also ist $alte_id[0] auch gleich 0. Dann weißt du das $a zu, es ändert sich nichts. Da du aber bei $id einen draufaddiert hast, ist $a und $id unterschiedlich und die Scheife ist sofort zuende.

Wie soll ich es denn sonst machen?

WAS willst du überhaupt machen, das ist leider nicht ganz ersichtlich. Vielleicht suchst du auto_increment oder MAX (), wenn du das machst um die letzt vergebenste ID zu suchen ist das extrem ineffizient. Dann lieber ein Query über alle IDs mit absteigender Sortierung.

dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/example-auto-increment.html

Es kann maximal eine Spalte die auto_increment Angabe haben!

and it must be defined as a key

Musst einen Primärschlüssel machen.

[phpdoc]mysql_insert_id[/phpdoc]

liefert nach einer mysql-operation die nummer eines hinzugefügten id-werts.
der output davon +1 sollte die nächste sein. while-schleifen gehören aus performancegründen bei sowas verboten, stellt euch vor was los ist wenn jedesmal 100000 einträge durchgerattert werden.